Mutasjon D614G er en missense-mutasjon som påvirker SARS-CoV-2-virusets piggprotein, SARS-CoV-2 er det koronaviruset som fører til covid-19.

Logaritmisk prevalens av D614G in 2020 etter sekvenseringer i GISAID-databasen[1]

Frekvensen av mutasjonen i den virale populasjon tiltok i løpet av pandemien. G (glycin) hadde erstattet D (asparaginsyre) i posisjon 614 i funn foretatt i mange land, særlig i Europa skjønt langsommere i Kina og det øvrige Øst-Asia. Dette støttet hypotesen at G øker transmisjonsraten, noe som er konsistent med høyere virus titer og infektivitet in vitro.[2] Forskere tilknyttet PANGOLIN-systemet gav mutasjonen tilnavnet «Doug».[3]

I juli 2020 ble det meldt at den mer smittsomme D614G SARS-CoV-2-varianten hadde bllitt den dominante form i pandemien.[4][5][6][7] Public Health England (PHE) bekreftet at D614G-mutasjonen virket moderat styrkende inn på smitteevnen, og at mutasjonen ble fulgt med på internasjonalt.

Den globale fremvekst av D614G-mutasjonen korrelerte med fremveksten av tap av luktesansen (anosmi) som symptom på COVID-19, muligens mediert av høyere binding til ACE2-reseptorens bindingsdomene eller høyere proteinstabilitet, og således økende infektivitet av lukteslimhuden.[8]

Varianter med D614G-mutasjonen er presentert i G klade av GISAID-databasen[2] og i B.1 -kladen i PANGOLIN-verktøyet.[2]

Referanser rediger

  1. ^ Maison, David P.; Ching, Lauren L.; Shikuma, Cecilia M.; Nerurkar, Vivek R. (7. januar 2021). «Genetic Characteristics and Phylogeny of 969-bp S Gene Sequence of SARS-CoV-2 from Hawaii Reveals the Worldwide Emerging P681H Mutation». bioRxiv : The Preprint Server for Biology: 2021.01.06.425497. PMC 7805472 . PMID 33442699. doi:10.1101/2021.01.06.425497.    Available under CC BY 4.0.
  2. ^ a b c Zhukova, Anna; Blassel, Luc; Lemoine, Frédéric; Morel, Marie; Voznica, Jakub; Gascuel, Olivier (24. november 2020). «Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2». Comptes Rendus Biologies: 1–20. PMID 33274614. doi:10.5802/crbiol.29. Arkivert fra originalen 21. februar 2021. Besøkt 19. mars 2021. 
  3. ^ Mandavilli, Apoorva; Mueller, Benjamin (2. mars 2021). «Why Virus Variants Have Such Weird Names». The New York Times. ISSN 0362-4331. Besøkt 2. mars 2021. 
  4. ^ Schraer, Rachel (18. juli 2020). «Coronavirus: Are mutations making it more infectious?». BBC News. 
  5. ^ «New, more infectious strain of COVID-19 now dominates global cases of virus: study». medicalxpress.com (engelsk). 
  6. ^ Korber, Bette; Fischer, Will M.; Gnanakaran, Sandrasegaram; Yoon, Hyejin; Theiler, James; Abfalterer, Werner; m.fl. (2. juli 2020). «Tracking Changes in SARS-CoV-2 Spike: Evidence that D614G Increases Infectivity of the COVID-19 Virus». Cell. 182 (4): 812–827.e19. PMC 7332439 . PMID 32697968. doi:10.1016/j.cell.2020.06.043. 
  7. ^ «SARS-CoV-2 D614G variant exhibits efficient replication ex vivo and transmission in vivo». science.sciencemag.org. 18. desember 2020. Besøkt 14. januar 2021. «an emergent Asp614→Gly (D614G) substitution in the spike glycoprotein of SARS-CoV-2 strains that is now the most prevalent form globally» 
  8. ^ Butowt, R.; Bilinska, K.; Von Bartheld, C. S. (21. oktober 2020). «Chemosensory Dysfunction in COVID-19: Integration of Genetic and Epidemiological Data Points to D614G Spike Protein Variant as a Contributing Factor». ACS Chem Neurosci. 11 (20): 3180–3184. PMC 7581292 . PMID 32997488. doi:10.1021/acschemneuro.0c00596.