SARS-CoV-2 My-varianten
SARS-CoV-2 My-varianten, også kjent som lineage B.1.621 eller VUI-21JUL-1, er en av variantene av SARS-CoV-2, viruset som forårsaker covid-19. Den ble først oppdaget i Colombia i januar 2021 og ble klassifisert som en variant of interest av Verdens helseorganisasjon (WHO) den 30. august 2021.[1] WHO uttalte at varianten hadde mutasjoner som indikerer risiko for at den har en viss resistens mot vaksiner, og at ytterligere studier måtte til for bedre å forstå den.[2] Utbrudd av my-varianten var blitt meldt i Sør-Amerika og Europa.[3] Lineage B.1.621 har en sublineage, som i PANGO-klassifiseringssystemet kalles lineage B.1.621.1, og denne var per august 2021 oppdaget i 20 land verden rundt.[4]
Under WHOs forenklede navnesystem ble B.1.621 gitt betegnelsen «my-varianten», og betraktet som variant of interest (VOI), men foreløpig ikke som en variant of concern.[1]
Klassifisering rediger
rediger
I januar 2021 ble den først dokumentert i Colombia og kalt lineage B.1.621.[5]
Den 1. juli 2021 gav Public Health England (PHE) lineage B.1.621 navnet VUI-21JUL-1.[6]
Den 30. august 2021 gav WHO lineage B.1.621 navnet My-variant.[1]
Mutasjoner rediger
My-genomet har totalt 21 mutasjoner, hvorav ni aminosyremutasjoner, alle av dem i virusets piggprotein: T95I, Y144S, Y145N, R346K, E484K eller the escape mutation, N501Y, D614G, P681H, og D109N.[7] Mutasjoner i viruset er intet nytt. Alle virus, også SARS-CoV-2, gjennomgår endringer over tid. De fleste mutasjoner er uten konsekvenser, men noen kan endre egenskaper som gjør disse virusene mer virulente eller i stand til å motså medisinsk behandling eller bruk av vaksiner.[3] En laboratoriestudie i Roma testet Pfizer–BioNTech COVID-19-vaksinen mot Mu-varianten, og fant at «despite several mutations in Spike, the SARS-CoV-2 Mu variant is neutralised by the Pfizer vaccine-elicited antibodies” with a lower effectiveness than that of other coronavirus variants».[5]
-
![Aminosyremutasjoner i SARS-CoV-2 My-varianten plottet inn på et genomkart av SARS-CoV-2 med et fokus på piggproteinet.[8]](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/06/SARS-CoV-2_Mu_variant_mutations.svg/3658px-SARS-CoV-2_Mu_variant_mutations.svg.png)
Aminosyremutasjoner i SARS-CoV-2 My-varianten plottet inn på et genomkart av SARS-CoV-2 med et fokus på piggproteinet.[8]
![Aminosyremutasjoner i SARS-CoV-2 My-varianten plottet inn på et genomkart av SARS-CoV-2 med et fokus på piggproteinet.[8]](/wiki/Fil:SARS-CoV-2_Mu_variant_mutations.svg)
| Gen | Aminosyre |
|---|---|
| ORF1a | T1055A |
| T1538I | |
| T3255I | |
| Q3729R | |
| ORF1b | P314L |
| P1342S | |
| S | T95I |
| Y144S | |
| Y145N | |
| R346K | |
| E484K | |
| N501Y | |
| D614G | |
| P681H | |
| D950N | |
| ORF3a | Q57H |
| del257/257 | |
| ORF8 | T11K |
| P38S | |
| S67F | |
| N | T205I |
Statistikk rediger
| Land | Bekreftede tilfeller |
|---|---|
| USA | 1.953 |
| Colombia | 850 |
| Spania | 471 |
| Mexico | 347 |
| Ecuador | 168 |
| Aruba | 84 |
| Italia | 77 |
| Chile | 72 |
| Nederland | 72 |
| Storbritannia | 55 |
| Puerto Rico | 50 |
| Østerrike | 49 |
| Costa Rica | 49 |
| Sveits | 48 |
| Canada | 47 |
| Den dominikanske republikk | 43 |
| Belgia | 34 |
| Portugal | 24 |
| De britiske jomfruøyene | 21 |
| Curaçao | 20 |
| Tyskland | 14 |
| Peru | 13 |
| Frankrike | 12 |
| Brasil | 10 |
| Bonaire, Sint Eustatius og Saba | 8 |
| Danmark | 7 |
| Polen | 6 |
| Venezuela | 5 |
| Irland | 4 |
| Finland | 3 |
| Sint Maarten | 3 |
| Slovakia | 3 |
| Sverige | 3 |
| Caymanøyene | 2 |
| Hongkong | 2 |
| Japan | 2 |
| Tyrkia | 2 |
| Gibraltar | 1 |
| Liechtenstein | 1 |
| Luxembourg | 1 |
| Malta | 1 |
| Romania | 1 |
| Turks- og Caicosøyene | 1 |
| Totalt: | 4.639 |
Referanser rediger
- ^ a b c «Tracking SARS-CoV-2 variants». who.int (engelsk). World Health Organization. Besøkt 1. september 2021.
- ^ «WHO monitoring new coronavirus variant named 'Mu'». france24.com (engelsk). 1. september 2021.
- ^ a b «Why Has WHO Designated 'Mu' A Variant Of Concern? Find Out All About It». ndtv.com. 1. september 2021.
- ^ «Lineage B.1.621.1». cov-lineages.org (engelsk). Besøkt 1. september 2021.
- ^ a b «Mu COVID variant: All you need to know about the new UK coronavirus strain». BBC Science Focus Magazine (engelsk). Besøkt 1. september 2021.
- ^ «Variants: distribution of cases data». gov.uk. Government Digital Service. Besøkt 1. september 2021.
- ^ a b c «Mu Lineage Report». outbreak.info. Besøkt 1. september 2021.
- ^ «SARS-CoV-2 variants - Stanford Coronavirus Antiviral & Resistance Database». covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. Besøkt 1. september 2021.