UEFA-cupen 1998/99 ble vunnet av den italienske klubben Parma FC med 3–0 i finalekampen over den franske klubben Olympique de Marseille. Dette var UEFA-cupens 28 sesong, og den andre sesongen med kun én finalekamp på nøytral bane etter en større omskiftning av kampformatet. Turneringens toppscorer ble Enrico Chiesa fra Parma FC med åtte mål totalt.

UEFA-cupen 1998/99
Forbund UEFA
Liga UEFA-cupen
Varighet 11. august 199812. mai 1999
Vinner Italias flagg Parma FC
2. plass Frankrikes flagg Olympique de Marseille
Toppscorer(e)
Italias flagg Enrico Chiesa (8 mål)
Se også: Kategori:Fotballturneringer

Første kvalifiseringsrunde rediger

Lag 1 Resultat Lag 2 1. kamp 2. kamp
FC Arges Pitesti   7-1   Dynamo Baku 5-1 2-0
FC Belshyna Babruisk   1-3   PFC CSKA Sofia 0-0 1-3
AC Omonia   8-6   Linfield FC 5-1 3-5
FC Shakhtar Donetsk   6-1   Birkirkara FC 2-1 4-0
Kolheti Poti   0-11   Røde stjerne Beograd 0-4 0-7
FK Inter Bratislava   4-0   SK Tirana 2-0 2-0
Tallinna Sadam   1-5   Polonia Warszawa 0-2 1-3
HB Tórshavn   2-4   Vaasan Palloseura 2-0 0-4
FK Željezničar   1-2   Kilmarnock FC 1-1 0-1
NK Mura Murska Sobota   8-2   Daugava Riga 6-1 2-1
ÍA   3-3 (b)   FK Žalgiris Vilnius 3-2 0-1
Hapoel Tel Aviv FC   6-2   FinnPa 3-1 3-1
FC Shirak   0-7   Malmö FF 0-2 0-5
Germinal Ekeren   4-1   FK Sarajevo 4-1 0-0
Shelbourne FC   3-7   Rangers 3-5 0-2
Otelul Galati   4-1   FK Sloga Jugomagnat 3-0 1-1
Union Luxembourg   0-7   IFK Göteborg 0-3 0-4
Ferencvárosi TC   14-1   Principat 6-0 8-1
Tiligul Tiraspol   0-6   RSC Anderlecht 0-1 0-5
Newtown FC   0-7   Wisła Kraków 0-0 0-7

Andre kvalifiseringsrunde rediger

Lag 1 Resultat Lag 2 1. kamp 2. kamp
Røde stjerne Beograd   4-2   SC Rotor Volgograd 2-1 2-1
Ferencvárosi TC   4-6   AEK Athens 4-2 0-4
Germinal Ekeren   3-5   Servette FC 1-4 2-1
FC Arges Pitesti   (b) 4-4   Istanbulspor AS 2-0 2-4
Molde FK   0-2   PFC CSKA Sofia 0-0 0-2
IFK Göteborg   2-2 (b)   Fenerbahçe 2-1 0-1
NK Mura Murska Sobota   0-2   Silkeborg IF 0-0 0-2
Rangers   2-0   PAOK FC 2-0 0-0
Slavia Praha   4-2   FK Inter Bratislava 4-0 0-2
Zürich   6-3   FC Shakhtar Donetsk 4-0 2-3
SK Brann   1-0   FK Žalgiris Vilnius 1-0 0-0
Wisła Kraków   7-2   Trabzonspor 5-1 2-1
Vejle BK   6-0   Otelul Galati 3-0 3-0
Hapoel Tel Aviv FC   1-1 (s)   Strømsgodset 1-0 0-1 (e.e.t.)
NK Osijek   3-3 (b)   RSC Anderlecht 3-1 0-2
AC Omonia   3-3 (b)   SK Rapid Wien 3-1 0-2
Vaasan Palloseura   0-3   Grazer AK 0-0 0-3
Polonia Warszawa   0-2   FC Dynamo Moskva 0-1 0-1
Hajduk Split   3-2   Malmö FF 1-1 2-1
SK Sigma Olomouc   4-0   Kilmarnock FC 2-0 2-0

Første runde rediger

Lag 1 Resultat Lag 2 1. kamp 2. kamp
AC Sparta Praha   2-5   Real Sociedad 2-4 0-1
Fenerbahçe   2-3   Parma 1-0 1-3
Blackburn Rovers FC   2-3   Lyon 0-1 2-2
FC Dynamo Moskva   5-4   Skonto FC 2-2 3-2
Vitória SC   2-4   Celtic FC 1-2 1-2
VfB Stuttgart   4-3   Feyenoord Rotterdam 1-3 3-0
FC Arges Pitesti   0-8   Celta de Vigo 0-1 0-7
Silkeborg IF   0-3   AS Roma 0-2 0-1
ŁKS Łódź   1-3   AS Monaco FC 1-3 0-0
PFC Litex Lovech   1-3   Grazer AK 1-1 0-2
RSC Anderlecht   0-2   Grasshopper Club Zürich 0-0 0-2
Fiorentina   2-1   Hajduk Split 2-1 0-0
Aston Villa FC   6-2   Strømsgodset 3-2 3-0
FC Schalke 04   1-1 (s)   Slavia Praha 1-0 0-1 (e.e.t.)
Servette FC   2-2 (b)   PFC CSKA Sofia 2-1 0-1
Røde stjerne Beograd   (s) 3-3   FC Metz 2-1 1-2 (e.e.t.)
FC Košice   0-8   Liverpool FC 0-3 0-5
Sporting CP   1-4   Bologna 0-2 1-2
NK Maribor   0-5   Wisła Kraków 0-2 0-3
Vejle BK   1-5   Real Betis 1-0 0-5
Bordeaux   3-2   SK Rapid Wien 1-1 2-1
Atlético Madrid   3-0   FK Obilic 2-0 1-0
Beitar Jerusalem FC   3-5   Rangers 1-1 2-4
Leeds United   (s) 1-1   CS Marítimo 1-0 0-1 (e.e.t.)
Udinese Calcio   1-2   Bayer Leverkusen 1-1 0-1
Steaua Bucureşti   3-7   Valencia CF 3-4 0-3
Willem II Tilburg   6-0   FC Dinamo Tbilisi 3-0 3-0
Zürich   7-2   Anorthosis Famagusta FC 4-0 3-2
Újpest FC   2-7   Club Brugge 0-5 2-2
Vitesse Arnhem   6-3   AEK Athens 3-0 3-3
SK Brann   2-4   Werder Bremen 2-0 0-4 (e.e.t.)
SK Sigma Olomouc   2-6   Marseille 2-2 0-4

Andre runde rediger

Lag 1 Resultat Lag 2 1. kamp 2. kamp
FC Dynamo Moskva   2-6   Real Sociedad 2-3 0-3
PFC CSKA Sofia   2-5   Atlético Madrid 2-4 0-1
AS Roma   1-0   Leeds United 1-0 0-0
Celtic FC   3-5   Zürich 1-1 2-4
Grasshopper Club Zürich   3-2   Fiorentina 0-2 3-0
Vitesse Arnhem   1-3   Bordeaux 0-1 1-2
Bayer Leverkusen   2-3   Rangers 1-2 1-1
Wisła Kraków   2-3   Parma 1-1 1-2
Grazer AK   3-7   AS Monaco FC 3-3 0-4
Werder Bremen   3-4   Marseille 1-1 2-3
Celta de Vigo   3-2   Aston Villa FC 0-1 3-1
Liverpool FC   (b) 2-2   Valencia CF 0-0 2-2
Bologna   4-1   Slavia Praha 2-1 2-0
Willem II Tilburg   1-4   Real Betis 1-1 0-3
Røde stjerne Beograd   3-5   Lyon 1-2 2-3
VfB Stuttgart   3-4   Club Brugge 1-1 2-3 (e.e.t.)

Tredje runde rediger

Lag 1 Resultat Lag 2 1. kamp 2. kamp
Real Sociedad   3-5   Atlético Madrid 2-1 1-4 (e.e.t.)
Roma   3-2   Zürich 1-0 2-2
Grasshopper Club Zürich   3-3 (b)   Bordeaux 3-3 0-0
Rangers   2-4   Parma 1-1 1-3
AS Monaco FC   2-3   Marseille 2-2 0-1
Celta de Vigo   4-1   Liverpool FC 3-1 1-0
Bologna   4-2   Real Betis 4-1 0-1
Lyon   5-3   Club Brugge 1-0 4-3

Kvartfinaler rediger

Lag 1 Resultat Lag 2 1. kamp 2. kamp
Atlético Madrid   4-2   AS Roma 2-1 2-1
Bordeaux   2-7   Parma 2-1 0-6
Marseille   2-1   Celta de Vigo 2-1 0-0
Bologna   3-2   Lyon 3-0 0-2

Semifinaler rediger

Lag 1 Resultat Lag 2 1. kamp 2. kamp
Atlético Madrid   2-5   Parma 1-3 1-2
Marseille   (b) 1-1   Bologna 0-0 1-1

Finale rediger

12. mai 1999
Parma   3–0   Marseille Luzjniki Stadion, Moskva
Tilskuere: 62 000
Dommer: Hugh Dallas (Skottland)
Hernán Crespo   26'
Paolo Vanoli   36'
Enrico Chiesa   55'