Kukes (albansk: Kukës) er en by nordøst i Albania med 10 816 innbyggere (2005). Byen er administrasjonssenteret til prefekturet med samme navn.

Kukes er kjent for rollen den spilte i Kosovokrigen på slutten av 1990-tallet. Byen tok i mot 150 000 flyktninger og ble i år 2000, som eneste by i historien, nominert til Nobels fredspris.