Villegagnonøya (portugisisk: Ilha de Villegagnon) er ei øy i munninga i Guanabarabukta i Rio de Janeiro. Den befinner seg i Zona Central, rett utafor Santos Dumont flyplass, som den er tilknytta via ei lita bru.

Villegagnonøya
LandBrasils flagg Brasil
Høyde o.h.5 meter
Kart
Villegagnonøya
22°54′50″S 43°09′35″V

Øya er oppkalt etter den franske admiralen Nicolas Durand de Villegaignon, hvis tropper okkuperte øya i 1555 og deretter bygde Fort Coligny under et forsøk på å opprette kolonien France Antarctique. Portugisiske tropper overtok øya i 1560. Villegagnonøya har siden 1938 tilhørt den brasilianske marinen.